La stazione ferroviaria di Novate Milanese, inaugurata il 5 ottobre 1879 sulla linea Milano-Saronno, ha avuto un ruolo significativo nello sviluppo del comune, trasformandolo da borgo agricolo a centro industriale e residenziale. Nel 1928, in concomitanza con l'elettrificazione della linea, fu realizzato un deposito locomotive adiacente alla stazione, comprendente anche una sottostazione elettrica. Tra la fine degli anni '80 e l'inizio degli anni '90, la stazione originale fu demolita e sostituita da un nuovo edificio, inaugurato nel 1992, in seguito al quadruplicamento dei binari sulla tratta Garbagnate-Novate Milanese.
